8 сентября 1797 г. на имя иркутского губернатора И.Т.Нагеля последовал именной указ об учреждении Американской компании с конторой в Иркутске. Через три года по именному указу от 19 октября 1800 г. Главное управление Российско-Американской компании переносится в Санкт-Петербург, а в Иркутске учреждается Иркутская контора, подведомственная Главному управлению.
В 1798 г. шелиховская Северо-Восточная Американская Компания соединилась с другой иркутской Компанией купца Мыльникова и получила название «Российско-Американская компания» с общим капиталом в 724 тысячи рублей, акт о создании которой компаньоны подписали 3 августа. Вступивший на престол в 1796 г. император Павел I покровительствовал как Компании, так и лично Г. И. Шелихову. В ноябре 1797г. был обнародован указ о возведении вдовы и детей гражданина Шелихова за заслуги мужа и отца их в дворянское достоинство с предоставлением им права вести торговлю. Вдова Шелихова Наталья Алексеевна 24 января 1799 г. составила условия раздела капитала в Американской компанией, оставшегося после смерти Г.И. Шелихова.
Общее паевое участие Шелиховых в Северо-Американской Американской Компании составляло акциями и ссудами на сумму 935700 рублей. Компания в 1797 г. владела следующими судами: фрегат «Феникс», голландский галиот «Три Святителя», английский галиот «Северный Орел», бригантина «Екатерина» и малые одномачтовые суда «Пегас» и «Дельфин», построенными в Америке. Шелиховский капитал был разделён между его детьми: Анной, состоявшей замужем за Николаем Петровичем Резановым (сыном председателя Иркутского совестного суда), Екатериной Темской, Авдотьей Булдаковой и незамужними дочерьми Александрой и Натальей, а также сыном Василием. На день смерти Г. И. Шелихова сыну было всего четыре года. Поэтому один из указов императора Павла I от 8 июля 1799 г. гласил: «Снисходя на прошение вдовы дворянки Шелиховой повелеваем, чтобы до совершеннолетия сына её со стороны семейства их находился опекун или поверенный в числе четырёх директоров, положенных для управления делами под высочайшим нашим покровительством Российской Американской компании, жалуя всемилостивейше сие право из уважения, что муж ее был из первоначальных заводителей сей торговли».
Другой указ императора Павла I от 8 июля 1799 г. гласил: «Польза и выгоды, проистекающие для империи нашей от промыслов и торговли, производимых верноподданными нашими по Северо-Восточному морю и в тамошнем крае Америки, обратили на себя наше монаршее внимание и уважение. Посему, принимая в непосредственное покровительство наше составившуюся по предмету оных промыслов и торговли Компанию, повелеваем ей именоваться: под высочайшим покровительством Российская Американская компания...».
Этим же указом утверждаются правила действия Компании и даются ей привилегии на 20 лет. Получение привилегий иркутское купечество 16 сентября 1799 г. торжественно отпраздновало. Первыми директорами Компании утверждены иркутские купцы первой гильдии Я.Н. и Д.Н. Мыльниковы, С. Старцев и зять Шелихова — М. М. Булдаков. Руководство Компании поручило Н. П. Резанову со 2 декабря 1799 г. быть «уполномоченным корреспондентом» Компании в Петербурге с возложением на него «во всём пространстве данной ему доверенности. . . ходатайствовать по делам Компании во всём, что к пользе её и сохранению общего доверия относиться может», т. е. защищать интересы Компании в государственных и других учреждениях.
Первоначально капитал компании (724 тыс. руб.) был разделен на 724 акции по 1000 руб. Мыльникову вместе с сыновьями принадлежало 132 акции.
В конце 1799 г. было принято решение о выпуске 1000 дополнительных акций номиналом по 500 руб., а к 1801 г. общее количество акций достигло 7350. Акции мог приобрести любой желающий.
Впоследствии было решено стоимость акции определять, исходя из суммы оборотного капитала, поделенного на 724, и она была весьма высокой. С учетом оборотных капиталов цена акции была определена в 3638 руб.
Весной 1802 г. император Александр I приобрел 20 акций за 10 тыс. руб., его примеру последовали члены царской семьи, после чего акции компании стали раскупаться государственными деятелями, дворянством и богатыми купцами. Первыми приобрели акции Н.П. Румянцев и Н.С. Мордвинов.
С 1816 года, компания начала эмиссию своих собственных денег (кожаные денежные знаки-марки достоиством в 1, 2, 5, 10 и 20 рублей печатались на тюленьей коже). В 1826 г. появились и разменные марки по 10, 25 и 50 копеек.
В 1818 г. в компании было 630 акционеров и около 45 % акций принадлежало владельцам крупных пакетов (100 и более акций). В 1819 году из 18 совладельцев компании только 8 были купцами, а 10 — придворными чиновникам. В 1844 г. из пяти директоров компании к торговле имел отношение только один, остальные были адмиралами и генералами.