Научное изучение Сибири и Дальнего Востока началось в царствование Петра I. Исследователи Мессершмидт Д.Г., И.Г. Гмелин, Вторая Камчатская экспедиция В. Беринга (1841 г.), позднее с П.С. Паллас, И.Г. Георги собрали ценные научные сведения о полезных ископаемых, водных ресурсах Сибири, о его коренных жителях.
Купечество живо интересовалось новыми землями на Камчатке, на Тихом океане, в странах Юго-Восточной Азии. Именно этот фактор сыграл большую роль в образовании Российско-Американской компании, которая стала первым успешным проектом частно-государственного партнерства в России.
Иркутская навигацкая школа также принимала участие в исследовании Сибири и Дальнего Востока. До сих пор не потеряли своего научного значения «Описание Иркутской губернии» (1805), «Географо-статистическое описание Иркутской губернии» (1812), «Обозрение разных происшествий до истории и древностей, касающихся Иркутской губернии и сопредельных ей стран (1812), «Историческое обозрение Сибири» (1837-1844) В этих трудах была дана широкая панорама освоения Сибири в 17-18 веках.
Вся эта деятельность подготовила создание ВСОРГО, которое организовало во второй половине 19 века ряд крупных экспедиций по изучению Восточной Сибири. Вилюйская (1854-1855), Амурская (1855), Уссурийская (1859), Олекминско-Витимская и Туруханская (1866). В 70-е годы А.Л. Чекановский исследовал Нижнюю Тунгуску, Оленек, Лену. И.Д. Черский, Б.И. Дыбовский, В.Годлевский исследовали Байкал. Была составлена карта геологического строения Прибайкалья.
В 1887-1889 гг. Сибирь изучали Г.Н. Потанин и Д.А. Клеменц. Значительную роль сыграла Якутская (Сибиряковская) экспедиция 1894-1896 гг. ВСОРГО финансировал экспедиции в Монголию. Результаты исследований публиковались в изданиях ВСОРГО – «Записки» - 12 книг с 1856 по 1886 гг. С 1870 г. началось издание «Известий» ВСОРГО, с 1896 г. – «Труды ВСОРГО».
Эстафету научного изучения Сибири продолжили в 20 веке советские ученые в рамках Сибирского отделения Академии наук (Иркутск).